야생의 정글을 꿈꾸는 얼룩말 마티를 친구로 둔 죄로 뉴욕 센트럴파크 동물원 4인방은 아프리카로 향하는 배에 몸을 싣게 된다. 그들이 도착한 곳은 미지의 정글 마다가스카 섬. "마다가스카"(Madagascar, 2005)는 인간의 품으로 돌아가고 싶은 동물이라는 역발상이 돋보이는 애니메이션이다.

얼룩말 마티는 유기농 풀을 먹고 러닝머신으로 체력을 단련하는 동물원에서의 삶이 무료해 견딜 수가 없다. 마티는 모두가 잠든 밤, 뉴욕 구경을 위해 동물원 탈출을 감행한다. 마티가 사라진 것을 안 알렉스, 기린 멜먼, 하마 글로리아는 마티를 찾아 지하철을 타고 도심을 쑥대밭으로 만든다. 결국 동물원 4인방은 인간에게 생포된다. 야생동물 보호론자들의 항의로 인해 케냐 야생동물 보호구역으로 향하는 배에 실린 4인방은 서로를 원망하며 싸운다. 같은 배에 탄 펭귄들은 배의 방향을 남극으로 돌리기 위해 배를 접수하고 배의 방향을 바꾼다. 이 과정에서 4인방을 실은 상자가 바다로 떨어진다. 표류 끝에 4인방은 마다가스카에 도착한다. 야성을 잃어버린 4인방은 과연 마다가스카에서 살아갈 수 있을 것인가?

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